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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
21/01/2022 |
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Data da última atualização: |
21/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
COSTA, J. A. da; AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, M.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, A. C. C. |
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Afiliação: |
JAQUICELE APARECIDA DA COSTA, UFV; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UFV; MOYSÉS NASCIMENTO, UFV; FABYANO FONSECA E SILVA, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPCa; ANA CAROLINA CAMPANA NASCIMENTO, UFV. |
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Título: |
A comparison of regression methods based on dimensional reduction for genomic prediction. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 2, p. 1-15, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.4238/gmr18877 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
multicollinearity and high dimensionality problems, making it impossible to obtain stable estimates through the traditional method of estimation based on ordinary least squares. To overcome such challenges, dimensionality reduction methods have been proposed, because of their simple theory and easy application. We compared three dimensionality reduction methods: Principal Components Regression (PCR), Partial Least Squares (PLS), and Independent Components Regression (ICR). An important step for dimensionality reduction and prediction is selecting the number of components, as it affects the linear combinations of the explanatory variables. The linear combinations are inserted into the model to predict the response based on a reduced number of parameters. We examined the criteria for the selection of the number of components. The dimensionality reduction methods were applied to genomic and phenotype data. We evaluated 370 accessions of Asian rice, Oryza sativa, which were genotyped for 36,901 SNPs markers considered to predict the genomic values for the number of panicles per plant trait.This data set presented multicollinearity and high dimensionality. The computational time for each method was also recorded. Among the methods, PCR and ICR gave the highest accuracy values, with ICR standing out for presenting estimates of the least biased genomic values. However, ICR required more computational time than the other methodologies. |
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Thesaurus Nal: |
Genomics; Regression analysis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230432/1/A-comparison-of-regression-methods.pdf
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Marc: |
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650 $aGenomics
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700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aNASCIMENTO, A. C. C.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Classificação |
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Registro |
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Status |
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| Registros recuperados : 307 | |
| 301. |  | SANTOS, A. B. dos; STONE, L. F.; FAGERIA, N. K.; PRABHU, A. S.; MAH, M. G. C.; AQUINO, A. R. L. de; AJIMURA, G. M.; BARBOSA FILHO, M. P.; ZIMMERMANN, F. J. P.; CARVALHO, J. R. P. de; OLIVEIRA, A. B. de; SILVEIRA FILHO, A. Efeito do conjunto de técnicas aplicadas ao sistema de produção do arroz de sequeiro. In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE ARROZ, 2., 1980, Goiânia. Resumos... Goiânia: EMBRAPA-CNPAF, 1986. p. 232-234. (EMBRAPA-CNPAF. Documentos, 13).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 302. | | SILVA, D. L. L. F.; FERREIRA, E. G. C.; BISSI, R. B.; AVELINO, B. B.; CHICOWSKI, A. S.; SILVA, D. C. G. da; SANTOS, A. B. dos; OLIVEIRA, M. F. de; ARIAS, C. A. A.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. SNPs validation for marker assisted selection of resistance to asian soybean rust. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018. não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 303. | | CHICOWSKI, A. S.; SILVA, D. C. G. da; RODRIGUES, H. P.; SOUZA, D. H.; SANTOS, A. B. dos; SANTOS, J. V. M.; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; ARIAS, C. A. A.; OLIVEIRA, M. F. E.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Marker assisted selection of resistance to soybean rust derived from RPP3. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 6., 2017, Ouro Preto. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2017. não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 304. | | BUENO, T. V.; FONTES, P. P.; ABE, V. Y.; UTIYAMA, A. S.; SENRA, R. L.; OLIVEIRA, L. S.; SANTOS, A. B. dos; FERREIRA, E. G. C.; DARBEN, L. M.; OLIVEIRA, A. B. de; ABDELNOOR, R. V.; WHITHAM, S. A.; FIETTO, L. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. A Phakopsora pachyrhizi Effector Suppresses PAMP-Triggered Immunity and Interacts with a Soybean Glucan Endo-1,3-β-Glucosidase to Promote Virulence. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 35, n. 9, p. 779-790, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 305. | | FAGUNDES, P. R. R.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES JÚNIOR, A. M. de; FRANCO, D. F.; CUTRIM, V. dos A.; NEVES, P. de C. F.; MOURA NETO, F. P.; PEIXOTO, O.; CASTRO, E. M. de; PETRINI, J. A.; ANDRES, A.; NUNES, C. D.; MARTINS, J. F. da S.; GOMES, A. a S.; VERNETTI JUNIOR, F. de J.; AZAMBUJA, I. H. V.; FONSECA, J.; BRONDANI, C.; LOBO, V. L.; SANTOS, A. B. dos; BASSANELO, P. Z.; SOARES, R. C. BRS Querência e BRS Fronteira, novas cultivares para a orizicultura gaúcha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 4.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 26., 2005, Santa Maria, RS. Anais... Santa Maria, RS: Orium, 2005. v. 1. p. 282-284.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 306. | | NEVES, P. de C. F.; FAGUNDES, P. R. R.; CUTRIM, V. dos A.; MORAIS, O. P. de; RANGEL, P. H. N.; CORDEIRO, A. C.; HECKLER, J. C.; LOPES, A. de M.; PEREIRA, J. de A.; MAGALHÃES JÚNIOR, A. M. de; LOBO, V. L.; CASTRO, E. da M. de; FRANCO, D. F.; MOURA NETO, F. P.; BASSANELO, P. Z.; PETRINI, J. A.; ANDRES, A.; NUNES, C. D.; MARTINS, J. F. da S.; GOMES, A. da S.; VERNETTI JÚNIOR, F. de J.; AZAMBUJA, I. H. V.; SANTOS, A. B. dos. Estratégia do melhoramento de arroz irrigado na Embrapa: ênfase nas avaliações em gerações iniciais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 4.; REUNIÃO DA CULTURA DO ARROZ IRRIGADO, 26., 2005, Santa Maria, RS. Anais... Santa Maria, RS: Orium, 2005. v. 1. p. 162-164.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 307. | | CASTILHOS, D.; POLESSO, A. M.; SILVA, A. C. F. da; SANTOS, A. B. dos; LOPES, A. T. de C.; OLIVEIRA FILHO, A. A. de; CUNHA, A. F. S. da; PUKER, A.; MATIOLI, A. L.; CAMPOS, A. A. S.; MORAIS, A. L. de; MODRO, A. F. H.; SILVEIRA NETO, A. A.; PIRES, A. de S. M.; BIASI, C.; PEIXOTO, C. M.; MERCÊS, C. da C.; CARVALHO, C. A. L. de; PAIVA, C. da S.; PEREIRA, D. S.; FREIRE, D. S.; SOUZA, D. C.; JONG, D. de; SOARES, D. A. M.; ARAÚJO NETO, E. R. de; SOUZA, E. A. de; SANTOS, E. B.; MAIA, E.; ARAÚJO, E. A. B. de; LIMA, E. G.; TEIXEIRA, E. W.; NASCIMENTO, E. G.; SILVA, F. A. S. e; CAPPELARI, F. A.; CHAGAS SOBRINHO, F.; FONTES, F. M.; OLINTO, F. A.; SILVA, F. E. J. da; BERGAMO, G. C.; RODRIGUES, G. A.; MORETTO, G.; CASADIO, G. M. L.; BOGUS, G. M.; CARVALHO, G. G. P. de; OLIVEIRA NETO, G. L. de; CASTAGNINO, G.; QUEIROZ, G. S. de; PIRES, G. P.; SILVA, H. M. da; SILVA NETO, H. B.; NUNES, H. T. de S.; OLIVEIRA, I. P. P.; SAMBRANA, I. R.; ROCHA, J. S.; BANDERÓ, J. L.; ALBUQUERQUE, J. G. S. S. de; HOLANDA NETO, J. P. de; KASTELIC, J.; GUERRA JUNIOR, J. C. V.; COSTA, J. R. da; JESUS, J. S. de; BENDINI, J.; GRAMACHO, K. P.; SOUZA, L.; LEONI, L. N.; GONÇALVES, L. S.; CESTARO, L. G.; MORAIS, L. da S.; DANTAS, L. F. C. F.; SERRA, L. S.; ABREU, L. de; BORSUK, L. C.; PINTO, L. F. B.; SILVA, L. A. da; LIMA, L. A. dos A.; FOGAÇA, M. J.; ISSA, M. R. C.; CORREIA-OLIVEIRA, M. E.; ALVES, M. L. T. M. F.; BARRETO, M. R.; REY, M. C. del; BARBOSA, M. J. de O. C.; SILVA, M. R. da; MORAIS, M. M.; VINHAL-SILVA, N.; GOMES, P. T. de O.; GUIMARÃES-BEELEN, P. M.; SOUSA, P. O. de; COSTA, P. S. C.; SOUZA, P. A. de; PAULA, R. de; MENDES, R. B.; GOMES, R. V. R. de S.; SANTOS, R. G.; NASCIMENTO, R. J. T.; SILVEIRA, R. D.; CABRAL, R. S.; TORRES, R.; BEELEN, R.; PEREIRA, R. A.; RIZZARDO, R. A. G.; CUNHA, S. A.; CELMER, S. T.; ESTEVAN, S.; ASSIS JUNIOR, S. L. de; MACIEL, S. V. S. A.; SILVA, S. J. R. da; MOREIRA, S.; SCHAFASCHEK, T. P.; BARROS, T. A. de; RUELA, T. H.; VITENA, T. M. de S.; BRIDI, T. R.; LEITE, V. M.; REIS, V. D. A. dos; NEVES, V. S. L. das; MEDEIROS, V. F. de. Varroa destructor infestation levels in Africanized honey bee colonies in Brazil from 1977 when first detected to 2020. Apidologie, v. 54, Article 5, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Pantanal. |
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| Registros recuperados : 307 | |
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